耶鲁大学有12个学院，60多个系所，450门课程。 所有这些院、系、所为本科生提供的课程加起来，平均每个学期大约有800门课供学生选修。但是每年只有大约三分之一的学生选择修读这些课程的全部或一部分。 耶鲁的文科课程（包括大部分本科及研究生专业）由人文与艺术学部管辖。该部共有六个学院——宗教、历史、哲学、英语、人类学和社会科学以及音乐和戏剧学院。每个学院下面又设有多个系所。
以英语语言文学系为例，这个系的学科方向分为英国文学和美国/拉丁美洲文学；戏剧和戏剧研究则属音乐和戏剧学院。这个系还负责教授全校通用的写作和语言学等课程。 以历史学系为例，它下设的中世纪与文艺复兴史、美国史、国际关系等几个专业，都具体划分了研究方向。但即使是同一个系，不同的教师也会有各自的研究重点。比如说同样是在历史系，有的研究美国政治发展史，有的研究全球健康史，还有的会从事经济或法律制度的史学研究。 所以，从文理学院起步，在耶鲁大学本科阶段，学生们可以接触到非常广博的学习领域；但在专业学习阶段，学生们则可以有机会进一步专注自己对某一知识领域的兴趣。
阚正银优质答主耶鲁大学学院是耶鲁最古老的学院，创建于1702年。大学提供人文学科、社会科学与自然科学领域的哲学硕士及博士学位。
哲学硕士项目鼓励学生进行不同学科及研究领域的学习。攻读哲学硕士的课程通常需两年，通过书面资格考试后学生即可毕业。博士课程的设置旨在将学生培养成大学教师及相关研究人员。完成三年的课程以及书面资格考试和口试后即可进入博士论文的撰写阶段。
艺术与科学研究生院由耶鲁大学教授团于1847年创建。该院通过12个学院提供160多个学位项目供选。其学位分为两大类：第一类是大学学士后学位(MAS)。包括教育研究与实践、环境研究、神学院研究、电影研究、历史研究、乐理研究、医学研究、国际研究和宗教研究等方面的硕士课程；第二类是从事艺术和学术研究而获的学位，包括艺术硕士、哲学硕士、博士等学位。
应用科学研究生院由耶鲁教授团于1911年创建。工程与应用科学领域的硕士及博士课程是该院的主要教学项目。
管理学院于1976年9月正式成立。现有学生970名，提供一年制工商管理硕士（MBA）学位项目。教师团队由67名具有杰出成就的常任教师组成，此外还有7名短期聘任教师。该院的课程设置既包括核心课程也包括多学科性的选修课程，通过各种实践与理论课提高学生作为未来管理者的决策能力。
